Der Veterinärdienst des NPZ Bern hat sich in den letzten zehn Jahren zu einer der bedeutendensten Pferdekliniken und Reproduktionsstation in der Schweiz entwickelt. Der Veterinärdienst stellte bereits zu EMPFA-Zeiten einen wichtigen Pfeiler des Betriebes dar. Die beiden Tierärzte Dr. med. Beat Wampfler und Dr. med. Stefan Bettschen haben die Pferdeklinik und Reproduktionsstation im letzten Jahrzehnt kontinuierlich ausgebaut und modernisiert.

Der Veterinärdienst erbringt Dienstleistungen für private Pferdebesitzer, Pferde des NPZ Bern und Pferde der Armee.